おっしゃる通り、朝起きた時はお口の細菌が多いです。
唾液には食べかすやプラーク（歯垢）を洗い流す自浄作用と、細菌の繁殖を抑える抗菌作用がありますが、就寝中は日中と比べて唾液の分泌量が減るため、一日の中で最も細菌が繁殖します。
細菌の増殖を抑えるために、就寝前の歯みがきをしっかりして、口の中に残る細菌を少しでも少なくすることがとても大切です！就寝前にしっかりみがいていただいていれば、起床時の歯みがきは軽くで良いと思います。

むし歯や歯周病を防いで歯の健康を保つためには、歯みがきでプラーク（歯垢）を取り除くことが大切なので、引き続き、食後の歯みがきはしっかり行ようようにしてくださいね。